由于事发地点靠近韩朝有争议的海上分界线“北方界线”附近海域，沉没事件发生后的第一时间，韩国媒体都在猜测沉没事件与朝鲜之间可能存在的联系。不过，韩国媒体随后即证实，事发地点虽然位于白翎岛和大青岛之间，但与“北方界线”仍有相当远的距离。
随着时间一天天过去，关于“天安”号出事的原因和过程，呈现出了部分清晰的轮廓，但仍有很多扑朔迷离之处。
首先是时间，韩国军方的表述一改再改，目前民间仍存异议。3月26日21时45分，这是李基植准将作为韩国军方代表最早宣布的事发时间，但他本人次日在国会作证时又将时间提前至21时30分。在“天安”号舰长崔元一举行记者招待会后，军方再次将时间调整到21时25分。而军方最新发表的事故时间，以最后通信记录和地震波为证，确定为21时22分。但有媒体披露，21时16分，一名船员在与家人通话时称“发生紧急情况”而匆匆挂断电话。青瓦台官员表示，这6分钟之间究竟发生了什么事情，军方会有个交待。
最大的悬案当然是原因。事件发生以后，“鱼雷攻击”“触发水雷”“内部爆炸”“自身缺陷”“乌龙事故”等各种说法不一而足，各种论断也遭到了不同程度的反驳。还有人质疑“天安”号为何离开常规路线进入“浅水区”，是否执行“特殊任务”？