位于琼崖纵队首次代表大会遗址的会址石碑。陈长宇 摄
配合渡海作战解放海南
琼崖纵队为了加速海南岛的解放，于1948年9月至1949年7月，集中主力向国民党军发动了秋、春、夏季攻势，歼灭4900余人，缴获迫击炮9门、轻重机枪130多挺、长短枪2400余支，解放了昌江、感恩县城和石碌铁矿，琼崖纵队发展到1.5万人。
1949年秋，国民党军一部先后从大陆退据海南岛，琼崖纵队遂转入保卫五指山中心根据地的反“清剿”斗争。12月，琼崖纵队遵照中共中央关于配合中国人民解放军第四野战军解放海南岛的指示，在动员岛上军民迎接主力部队渡海登陆的同时，还派出部分干部，带领一批船工和船只到达雷州半岛，积极配合渡海登陆兵团做好准备。
1950年3至4月初，纵队以5个团先后4次成功接应第15兵团2个加强营和2个加强团偷渡登陆，为主力部队大规模渡海作战创造了有利条件。4月16日，兵团主力实施强渡登陆作战，琼崖纵队以全部10个团分别担任接应和配合任务。17日，兵团主力登陆成功后，琼崖纵队即配合主力进行琼北地区的围歼战和追歼逃跑的国民党军，至5月1日全岛解放。此时琼崖纵队总人数达到2.5万余人。此后，琼崖纵队又担负剿匪和保卫海防的任务。
1950年7月，根据中南军区命令，琼崖纵队改编为中国人民解放军海南军区。