还有一些理性的网友认为这次的学术造假不是小保方晴子一个人的问题，早稻田大学方面也有值得改进的地方。
“我想论文造假不是她一个人干的。”
“那就是说当初没有认真审查咯。”
“如果数据本来就不存在的话怎么能修改呢？这样的事情只需几天就能调查清楚。这是早稻田在给自己制造不在场的证据，为了说明他们在教育上没有疏漏。在授予（小保方晴子）博士学位的那一刻，早稻田就完了。”
“虽然我认为决定是妥当的，但是当初的导师、审查论文的教授们如何处分呢？”
曾经的“学术女神”小保方晴子就此黯淡离开学术界，但是这一事件似乎远没有结束。小保方在声明中说，她将于本年度内在网上公开她再次提交的博士论文以及相关数据，到时不排除再度引发骚动的可能性。
另外，是小保方故意说谎，还是幕后有教唆的黑手，仍然是这一事件尚未解开的谜团。小保方曾经的上司、著名干细胞科学家笹井芳树去年自杀身亡也给大家疑点重重的感觉。
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