菲方公布的最初在黄岩岛泻湖内避风的中国渔船。渔政303船抵达黄岩岛后，中方执法船处于3:1优势，13日渔政303船与海监84、71船协同，掩护全部12艘中国渔船带着渔获离开黄岩岛。
4月13日 中方3船：菲方1船中方动作
中方3艘执法船掩护12艘渔船突围
中菲双方自11日就对峙事件展开外交谈判，谈判中的菲方立场逐渐软化。最初要求扣留渔船和渔民，予以处罚；后来提出，中方交出渔获后，渔民渔船即放行。我大使则称，渔获只能交给我渔政部门检查是否合法。正当双方外交官争论不休之时，我方开始了礁湖突围行动——
具体情况，菲媒体的描述是一片混乱和矛盾。可能的推测是：中方的两艘公务船——中国海监75船和中国渔政303船一前一后，分别掩护我渔船队突围，渔获被我渔船全部带走。
上午，中国海监75船率领7艘渔船突围。在礁湖出口处，菲海警唯一的“邦板牙”号搜救船因为被中国海监84船阻挡，因此看不到礁湖内的情况，也看不到中方渔船是如何离开的。菲军只能靠定时空中观察礁湖内剩余的渔船数量来判断动向。傍晚大约6时，中国渔政303船率领余下的5艘渔船突围。在场的一艘菲律宾渔船发现了这个情况，随后向菲海警报告。
除“琼·琼海02096船”和“琼·琼海09099船”两艘渔船返回海南琼海市潭门港外，大部分中国渔船前往西沙和南沙海域继续生产。中国渔政303船在连续守礁两个月后，返回广州进行补给。中国海监84船继续留守黄岩岛，和菲律宾搜救船对峙。
曾遭菲军袭扰的“琼·琼海09099船”于14日晚安全返抵海南潭门港。图为该船4名船员在渔船前合影。
菲方表态
菲外长称允许中国渔船自由离去
对于中国渔船的离开，菲律宾外交部长称，允许中国渔船自由离去（但第二天菲律宾外交部改变了说法）。
中方表态
敦促菲方妥善解决对峙事件，重申拥有黄岩岛主权
当天下午，中国外交部发言人刘为民在例行记者会上说，中方敦促菲律宾从中菲友好关系大局出发，与中方共同努力，尽快妥善解决黄岩岛海域对峙事件。
当天晚上，中国驻菲律宾大使馆网站刊发题为《中国对黄岩岛的领土主权拥有充分法理依据》的文章。文章指出：中国对黄岩岛的领土主权拥有充分法理依据，且一直对黄岩岛进行长期开发和利用，而事实也充分证明，“黄岩岛处于菲律宾领土范围之外，根本不是菲律宾领土”。