在警车上，王鹏试图去解释宁夏吴忠警方对此事没有管辖权，依据法律不断地解释自己并没有过错。但据他回忆，带队的刑警大队副队长石志刚根本不理睬他的解释，还挥拳打了他的左脸，很重，很疼。这样的遭遇在后来他被提审时也重复过。
当天20时许，王鹏被带进了吴忠市看守所。他已经一整天没有吃饭了。
眼前是一间长方形的屋子，水泥地面，七八个人睡大通铺。
8天里，他被提审了两次。分别发生在 11月23日和24日。
据王鹏说，在第一次提审中，石志刚问他有没有诽谤。“我只承认了一份写给马晶晶的骂人的信，仅仅是辱骂，而且是在被打的情况下，被打得没办法。2009年的时候匿名写的，主要是谴责他。”
他说：“24日下午，第二次讯问我。这次也有打我。也是扇我的耳光，打我的头。打我的都是石志刚。他还恐吓我，你必须要承认，你不承认的话，我就把你爸爸妈妈都抓起来，让你家破人亡。”
王鹏说，在一次审问中，有人给他提示，“判你一天，也要判”。这让他看不到任何的希望。
王鹏回忆说，在吴忠市利通分局的一楼讯问室，刑警大队副队长石志刚曾威胁他，“必须按照我说的，不要把你弄成第二个赵作海。你知道赵作海是谁么？赵作海不是没犯罪吗，不还在牢里那么多年？我定你的罪还不是小菜一碟。”
对于王鹏反映的有个别警员对其实施过暴力，新任利通区公安分局局长吴海波表示，在《吴忠市关于利通区公安分局民警赴甘肃刑拘图书管理员王鹏一事做出的决定》中，第三条指出：“对涉及本案的相关问题进一步依纪依法调查处理”。吴海波称，按照吴忠市委市政府的要求，由市政法委牵头，由市公安局和利通分局的纪委组成了联合调查组，针对整个案件过程中是否存在违法乱纪行为，将进行全面调查。
吴海波称，若经查证属实，存在刑讯逼供，或其他滥用职权的行为，将坚决查办，绝不姑息。